1874年日本第一次入侵台湾没有吃到甜头，法国人紧随而至。朝廷委派刘铭传前往台湾指挥抗战，左宗棠也随之南下福建。中法战争结束后，刘铭传就留在了台湾，全身心地投入到了治理台湾的工作中。1885年10月12日（光绪十一年），在左宗棠去逝的第38天后，清朝政府批准了沈葆桢、丁日昌、刘铭传等人的奏请，改建台湾道为台湾省。刘铭传出任台湾省第一任巡抚。
经历了两次鸦片战争，平定太平天国运动，中法战争等一系列战事，清廷在风雨中摇曳不定，大伤元气。在经过洋务运动后，清朝状况有所好转，尤其是在建立北洋舰队后，国力大大增强，并还出现了晚清时期的中兴。不过朝廷也不再那么有钱了，国库巨亏，入不敷出。可就是在这样的情况下，慈禧却依然还过着骄奢的生活，让朝廷为之修建了颐和园，以享晚年。为了她的六十大寿，朝廷上下就花费了8000多万两白银。
朝鲜东学党起义，日本终于等来了机会，以平定叛乱为由出兵朝鲜。日本对外宣称只有四百余人的海军陆战队，可实际上却是派出了八千余人的庞大军队。朝鲜国王向清政府求援，清政府同意派兵援助，可也只是去了四百余人，加上清驻朝部队，也就是两千人左右。结果可想而知。
清军驻朝最高统帅叶志超因畏战弃城而逃，以左宝贵、林永升等人为代表的爱国人士奋起反抗，英勇牺牲，平壤失陷，清军大败。李鸿章再次紧急调派1000余名士兵，租用英国商船“高升”号由海路增援朝鲜。但途中遭到日本军舰的偷袭，由此揭开了中日甲午战争的序幕。
日军袭击清军运兵船，朝野轰动，朝廷上下一片喊打声，纷纷要求迅速打击报复日本。很快朝廷对日宣战。
时值清军与日军实力上还有很大差距。以海陆而言，清朝当时可用之军只有淮军和北洋水师。其中一部分淮军驻扎直隶，拱守京城之外，其余则在奉天一带。一旦出境援朝击倭，必然留下空隙为敌所乘。而北洋水师能够参与作战的舰船仅有8艘，其余船只只可供操练和运输之用。船舰严重缺少维护不说，弹药更是短缺。光绪十九年（1893年），醇亲王检阅北洋水师时，主力战舰定远舰只剩下3发炮弹。丁汝昌出于颜面，只好设置人肉靶船。即预先在靶船上布置好炸药和士兵，待演习时由人为引爆靶船。
北洋水师建立较早，所购之船舰虽乃当时世界先进战舰，可自购置后从未进行过更新装备，航速缓慢，旗舰定远舰的航速也就14.5海里。而日本海军能够参与作战的舰只就有21艘，这在数量上就已远远胜过北洋水师。其中有9艘是光绪十五年（1889年）分年购置，且船速都非常快，最快航速可达23海里，其余也在二十海里上下，旗舰吉野舰的航速为22.5节。平均起来日本舰只航速比北洋舰只快5海里左右。
北洋舰队有定远、镇远两艘主力战舰，也正因其大，吃水过深，行动迟缓。两舰原设大小炮位均为旧系。经远、来远、济远三船也因年久失修，威力大大减退，经远、来远尚无尾炮。北洋舰队虽配有10英寸巨炮，可总体上设备陈旧，武器落后。我方五分钟开一炮，日方却是一分钟开五炮，火力方面更是严重处于下风。
光绪任命李鸿章为军事总指挥，严饬攻打日军。李鸿章在仔细分析了双方的实力后，认为开战时机还不成熟。李鸿章分析道，舍我之短，取我之长。北洋水师并非全不能战，船速慢不利于进攻，然用于自守则绰绰有余，一旦开战，可保船制敌。借此一方面抓紧备战，另一方面请英俄等国出面调停，以拖延时间。
李鸿章的战略思想是正确的，但翁同龢却与他始终过不去。这还得从1862年的清军与太平军的战争说起，李鸿章奏折弹劾了翁同龢的长兄翁同书弃城逃跑，翁同书被咸丰皇帝批示“拟斩监候”，后被充军新疆。从此翁同龢便怀恨在心，处处和李鸿章作对。翁同龢身为户部尚书，掌管财政，但自北洋舰队建立之日，他就从未批给过北洋舰队任何军费。即使在明知清朝没有取胜把握的情况下，仍然卖力地鼓动对日作战。他私下里对别人说：这次就是要整垮他（李鸿章），整的让他永无翻身之日！后来真如他所愿，但清朝却战败了。可这样他仍不放过李鸿章，即便是李鸿章背着骂名隐退朝廷，翁同龢针对他的非难和进攻也没有停止过。李鸿章曾说过：然则重臣不和，实属国家不幸。这也是典型的公报私仇毁江山的深刻的历史教训。
在光绪的一再严逼下，李鸿章调集了8个营的兵力，再次由海路前往朝鲜，并由北洋舰队全程护航。然而不幸的是，这个机密被李鸿章的外甥出卖给了日本人。一次震惊中外的战争开始了。
在途中，舰队遭到早已埋伏好的日本舰队的袭击，北洋舰队随即与其激烈交火，经过5个小时的浴血奋战，还是终因军力上的悬殊和弹药短缺，北洋舰队被击沉包括镇远舰在内的4艘舰只，惨遭失败。
由于炮弹打光，定远舰管带刘步蟾服毒自戕。退守威海卫的丁汝昌也因没有抵住日军的进攻，自杀报国。
黄海大战真可谓战火纷飞，硝烟滚滚，炮弹落在海面上，犹如水柱擎天，场面异常惨烈、悲壮，但特别值得一提的是镇远舰管带邓世昌亲临一线指挥，率领全舰官兵激慨奋昂，英勇作战。不久舰上弹药全部打光，邓世昌下令开足马力全速撞向日军旗舰吉野号，吉野见状慌忙逃跑，在逃跑的过程中向镇远发射鱼雷，就在即将撞上吉野时，镇远不幸被敌舰的鱼雷击沉。邓世昌和他的士兵壮烈殉国。
然则就是在如此明显敌强我弱的劣势下，北洋舰队同仇敌忾，浴血奋战。虽因寡不敌众，损失惨重，但仍然还是重创日本海军。换言之，日本也是依靠运气赢在侥幸。
北洋舰队虽败犹荣，全体官兵表现出了高昂的斗志和大无畏的英雄主义精神，可歌可泣，流芳千古，让后人为之啧啧称赞！
战后，朝廷派出以伍廷芳为代表的使团前往日本议和，但日本方面拒绝与其谈判，要求清廷让李鸿章出面。李鸿章当时在日本政界有很大的声誉，直到现在，李鸿章也是日本人最为熟悉和钦佩的中国历史故事人物之一。李鸿章当时对日本的底线是不割地，赔款最多不过一亿两白银。但日本方面却狮子大开口，提出了赔偿军费3亿两白银，割让辽东半岛和台湾全岛及附属岛屿等严苛条件。双方态度都十分强硬，互不相让。就在这时，李鸿章在日遇刺，日本政界掌权人大惊，并下令全力为李鸿章疗伤，在经过一段时间治疗后，李鸿章幸无大碍。与此同时，日本为了给清廷和李鸿章施加压力，在山海关附近大举增兵。朝廷更是紧张，被迫让步，然后密令李鸿章与之速速媾和。最终双方相互作了些让步，并签订了《马关条约》。条约指出，清廷赔偿日本军费2亿两白银，割让台湾全岛等。
甲午战败，举国上下一片震惊，朝廷罢免了李鸿章，李鸿章之后赋闲于北京贤良寺。朝廷重新启用恭亲王奕訢，主管外交，军政，启用西安将军荣禄，接替李鸿章。受李鸿章的推荐，荣禄让袁世凯试练新式陆军。
恭亲王奕訢在临终之时，告诫光绪要一定要重用张之洞和李鸿章，而罢免翁同龢。而后光绪罢免了翁同龢，慈禧重启李鸿章，可李鸿章指出学习西洋只是学了个表面，照猫画虎，而最根本的东西是学不到的。因此特意提出要求出国考察先进国家，慈禧向来也是厚重于他，同意他出访欧美等国。这也是中国近代史上第一次高官出访。
不少人认识到国家的落后，纷纷要求清廷整改政治，这时以康有为、梁启超为代表的维新派受到光绪的青睐。1898年，光绪皇帝开始试行维新变法，大胆启用新人，一度如火如荼，史称“戊戌变法”。可以徐桐、刚毅为首的保守派却百般阻挠，一再破坏维新运动，光绪遂之将其逐出朝廷。最后他们找到慈禧，肆意污蔑维新运动。慈禧在不知情的状况下，大为愤怒，再度复出，重揽政权。
慈禧下令诛杀维新运动，逮捕维新变法人士。光绪秘密下诏康梁等人，通知他们迅速避难。谭嗣同曾找到袁世凯，密谋造反，围攻颐和园。但不料袁世凯首鼠两端，出卖了谭嗣同，从而也有了“戊戌六君子”的悲壮佳话。康有为、梁启超等人逃到日本进行政治避难。光绪随即被慈禧软禁在南海瀛台，从此成了一个没有实权，徒有虚名的皇帝。
“戊戌六君子”：杨锐、刘光第、康广仁、杨深秀、谭嗣同、林旭。
“我自横刀向天笑，去留肝胆两昆仑！”——谭嗣同
维新变法只是昙花一现，清王朝从此走向低谷，一蹶不振。江山易改，秉性难移，封建制度深入人心，不易变革。虽然后来孙文创立了共和国，但资本主义在中国也行不通。
逃到日本避难的康有为，梁启超向国际社会揭露了真像，国际社会大为震惊。西方国家联合向清廷发出照会，要求慈禧解禁光绪，迅速归政。在华西方传教士仗势欺人，强占土地，建立教堂。不久，山东和河南交界处兴起“义和团”运动，他们打着“扶清灭洋”的口号，杀死了一些传教士，反抗在华洋人。其中，德国以驻华公使遇刺事件为由，出兵强占胶州湾。“义和团”非但没有受到惩办，反被慈禧编为义军。西方列强对此强烈不满，十一国家联合向清廷发出照会。慈禧极为愤怒，又受刚毅、徐桐等人蛊惑，一气之下竟向英国、法国、德国。美国、意大利、奥地利、沙俄和日本八国宣战。1900年夏天，八国联军攻陷大沽口，很快侵占北京。慈禧和光绪只好暂时外逃至西安避难。李鸿章在戊戌后出任两广总督，受任于败军之际，奉命于危难之间，李鸿章再以北洋大臣，直隶总督的身份出面，北上议和，最终与列强签订了《辛丑条约》。条约规定，清军赔偿八国联军军费4.5亿两白银，清军不可在天津方圆二十里内驻兵，联军可在通州、廊坊地区驻兵等。
1901年慈禧回銮。经历了这次的战争，清朝已是岌岌可危。慈禧认识到了问题的严重性，决定不再闭门造车，大力启用新人，试行新政改革。受荣禄保荐，瞿鸿禨被破格提为军机大臣。在签订《辛丑条约》后不久，李鸿章去逝。他和荣禄都共同举荐由袁世凯接管北洋和直隶。袁世凯也不负众望，他在天津办新学，改新政，兴民业，修铁路，创实业，一切都井井有条，可圈可点。
1904年，在张之洞和袁世凯的联合奏议下，经过激烈论战，清廷废除了一千多年的科举制度。但同时也在新式学堂保留论语、经理之类的传统国学，可谓远名之举。
张之洞和袁世凯也早已表示需要立宪，主张改行君主立宪制。日本在1904年的日俄战争中战胜了专制国沙俄。此后，俄国也宣布改政。清朝此时是世界上惟一的的专制国，在此局面下，慈禧考虑改制立宪。
朝廷派出皇室成员载泽，湖南巡抚端方等五人前往欧美等国考察宪政。在历时一年多后，最后经日本回国。经朝廷商榷，觉得将立宪预定期定为12年。而马上就是首先厘定新官制，改革行政机构。
由于政治腐败，封建思想根深蒂固，朝中大臣无法一下全盘化接受西方先进理念，对于由袁世凯厘定的新官制大为不满，尤其是大大折损那些皇亲国戚的利益。所以，举国上下文武百官以居心叵测为由，一致请杀袁世凯。慈禧又不忍心杀了袁世凯，毕竟他在新政方面还是取得了不俗的成绩。但又不能不顾满朝百官的意愿，只好顾全大局，收回了袁世凯的军权和兼差，改任瞿鸿禨为新官制厘定总司。
袁世凯拥权自重，为了发展自己的势力，与贪污腐败的庆亲王奕劻相互勾结，同流合污。风节峻厉，操守廉洁的瞿鸿禨早就费尽心思弹劾他们。这次他又身为朝廷重臣，原本顺风顺水，就在关键时刻他的最好的学生孙毓鼎却操之过急，犯了巨大错误，导致弹劾失败。更糟的是，慈禧也对瞿鸿禨失去了信任。庆亲王奕劻和袁世凯趁机反击，花了大心思妄图买通孙毓鼎，让其弹劾瞿鸿禨。最后，还是瞿鸿禨主动找到孙毓鼎，让其大义灭亲，弹劾自己。之后，慈禧提用张之洞和袁世凯，与醇亲王载沣共同行走军机处。
不久慈禧病危，在此期间，慈禧任命载沣之子溥仪为嗣皇帝，载沣为监国摄政王。1916年11月14日，光绪三十四年十月二十一日，光绪皇帝崩，年三十八岁。隔一日，慈禧太后崩，年七十三岁。
从此清国民不聊生，荼毒生灵，直到辛亥革命爆发。武昌起义成功后，1916年12月25日，孙中山回到上海，结束了他长达16年的海外漂泊。12月29日，孙中山被众省代表推选为临时大总统，在南京宣布成立中华民国，从此拉开了中国近代革命的大幕。
孙中山和袁世凯秘密和谈，孙中山承诺，只要袁世凯能让清廷逊位，并保持国体是共和制，他可以让出总统职位。眼看各地揭竿而起，众省宣布独立，大势所趋，隆裕太后在与袁世凯达成一致后，隆裕同意清廷逊位。就这样，袁世凯很轻而易举的窃取了革命果实。
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