巴斯德应用免疫方法预防畜禽疾病获得成功之后，他马上把这种方法应用到防治人类传染病上来。他首先进行的是防治人类狂犬病研究。

　　根据他的细菌免疫原理，巴斯德起初也认为狂犬病起因于一种细菌，但是在显微镜下，却总看不到这种细菌，因此他无法将之分离出来加以培养(后来人们认识到，引起狂犬病的是比细菌更小的病毒)。经过多次试验，巴斯德创造性地发明了活体培养法制取疫苗。他将狂犬的毒液接种到兔子的脑膜下，兔子死后将其脊髓提取出，再接种到另一些兔子的脑膜下，这样经过数次培养，终于在1885年制成了毒性极微弱的狂犬疫苗。这种疫苗对预防和治疗狂犬病效验十分显著，但未曾在人身上使用过。为了尽快用于救治病人，巴斯德决定先在自己身上试验。正在这时，一位被狂犬咬伤的名叫梅斯特的9岁男孩，在他母亲的陪同下，来到巴斯德实验室，恳求巴斯德给予治疗。这位仁慈的科学家，在自己身上试验可以毫无畏惧，但给小孩接种这种疫苗却深感不安，难以决断。抢救工作不容耽搁。在小孩母亲的再三要求下，巴斯德还是给小孩注射了疫苗。

　　注射疫苗之后，巴斯德一直守护在小梅斯特身边，仔细观察病情的变化。这是一个充满希望、忧虑和痛苦的日子。有一天晚上，巴斯德竟做了一个噩梦，梦见小梅斯特狂犬病发作，正在狂乱地挣扎，在窒息中痛苦地死去。巴斯德梦中惊醒之后，立刻对梅斯特检查了一遍。小孩一切都很正常，巴斯德才放下心来。14天的治疗期过去了，一个月又过去了，梅斯特非常健康、活泼可爱，不久就痊愈出院了，治疗非常成功。

　　梅斯特是人类历史上第一例用狂犬疫苗治好的狂犬病患者。它是一个里程碑，标志着人类已跨进了免疫时代。

　　巴斯德用狂犬病疫苗治好了大量狂犬病人。在治愈梅斯特的第二年，一些来自俄罗斯、英国、阿尔及利亚及法国的狂犬病人，都慕名请求巴斯德给予治疗。这一年他治好了1726人，除10人因耽误了时间死亡外，其余全部健康出院。这数千人的生命，都是巴斯德从死神那里抢回来的。巴斯德被人们尊称为“人类健康的保护神”。

　　以后，在巴斯德免疫理论的指导下，各种各样的疫苗都制造出来了。各种凶恶的传染病，如肺结核、白喉、天花、脑膜炎、小儿麻痹症都有了相应的疫苗进行预防。

　　1895年，巴斯德在巴黎与世长辞了。但他为人类立下的不朽功绩永载史册。正是在巴斯德的努力下，揭示了微生物世界的奥秘，使人类第一次认识到那些曾夺去千千万万人生命的传染病，其中包括14世纪游荡在欧洲大陆，几乎夺去全欧一半人15生命的“黑死病”，都是由相应的微生物——细菌或病毒引起的。他又找到了可靠的防治传染病的方法——弱毒免疫法，自19世纪中叶以来，由于传染病得到有效的控制，世界人口的寿命延长了一倍，人类真正获得了第二次生命。在人类与疾病做斗争的历史上，巴斯德揭开了光辉的一页。